Mae angen ystyried sawl ffactor wrth storio papur pecynnu i sicrhau ei ansawdd.
O ran tymheredd, dylid ei gynnal rhwng 10 gradd a 30 gradd. Gall tymheredd gormodol achosi i'r papur anffurfio a'r glud i feddalu; bydd tymheredd rhy isel yn gwneud y papur yn frau ac yn hawdd ei niweidio.
Mae rheoli lleithder yn hollbwysig; yn ddelfrydol dylid cynnal y lleithder cymharol rhwng 40% a 60%. Gall lleithder gormodol achosi i'r papur fynd yn llaith ac wedi llwydo, a'i gryfder i leihau; gall lleithder rhy isel achosi i'r papur sychu a chracio, a chynhyrchu trydan statig.
Dylid cadw'r amgylchedd storio yn lân ac wedi'i awyru'n dda, gan osgoi cronni llwch a malurion i atal halogi'r papur pecynnu. Dylid hefyd ei gadw i ffwrdd o ffynonellau dŵr a sylweddau cyrydol i atal lleithder a chorydiad.
Wrth storio, dylid pentyrru papur pecynnu yn daclus er mwyn osgoi cywasgu ac anffurfio. Ar gyfer papur gyda siapiau neu strwythurau arbennig, gellir defnyddio silffoedd pwrpasol neu ardaloedd storio ar wahân. Yn ogystal, dylid cymryd mesurau rheoli pryfed a chnofilod, megis gosod ymlidyddion pryfed, i atal difrod i fagiau papur a blychau.
